芝加哥大学研究生院分为四个学部:
一、数理学部
天文与天体物理系
化学系
计算机科学系
地球物理系
数学系
物理系
统计系
生物物理动力学研究所
计算研究所
恩里科·费米研究所(高能物理与天体物理)
詹姆斯·弗兰克研究所(材料科学与工程)
史蒂文诺维奇金融数学中心
二、生物学部
三、人文学部
弗兰克人文科学研究所
四、社会科学部
人类学系
人类比较发展学系
历史系
经济系
政治科学系
心理系
社会思想系
社会学系