波恩大学并非校园式大学，而是各个建筑分布于整个城市内。大学主楼即前选帝侯宫殿在市中心，该地区分布着一些现代建筑如法学院，神学院和哲学院等。
自然学科主要集中在泊波尔多夫区，泊波尔多夫宫殿和19世纪的现代办
公楼为主。泊波尔多夫宫殿花园自1819年作为植物园存在。计算机学科分布在两个位置。老的供给中心和国家机关楼(前警察总部等)。心理学位于城北的LVR医院。医药学位于费努斯贝格。个别机构和设施分布在其他城区如天文学，化学和部分医药学。
总体而言大学拥有371幢建筑。除了教学和行政自用好包括由学生服务中心负责的四个食堂和34栋学生宿舍约4200间房间。
