建校几百年来,曾有许多热门学者在马尔堡大学工作,也有许多知名人物从这里毕业。其中自然科学领域的知名人物有:
埃米尔·阿道夫·冯·贝林:医学家、细菌学家,1901年诺贝尔生理学或医学奖获得者。
卡尔·费迪南德·布劳恩:物理学家,1909年诺贝尔物理学奖获得者。